Karşıyaka, yeni sezon öncesinde TFF 3. Lig'e iddialı bir giriş yapmak için transfer atağına geçti. Ligin gol kralı İshak Kurt'u kadrosuna katan ve 1 yıl aradan sonra Metin Peker'i takıma geri döndüren yeşil kırmızılılar, güçlü bir kadro oluşturma yolunda önemli adımlar attı. İshak Kurt, geçen sezon Adana 1954 FK ile 3. Lig 4. Grup'ta şampiyonluk yaşayarak attığı 22 golle dikkat çekmiş, sonrasında Efeler 09 SFK'da Play-Off'larda 24 gol kaydetmişti. Bu başarılarının ardından Karşıyaka'ya transfer olan İshak'ı, rakip Bursaspor'un teklifine karşı İzmir'e getiren Futbol Şube Başkanı Gökhan Şensan, oyuncuyla anlaşma sağladı.
Hücum hattını güçlendirmek amacıyla Karaköprü Belediyespor'dan Ali Sinan Gayla'yı transfer eden Karşıyaka, savunma gücünü de eski oyuncusu Metin Peker ile pekiştirdi. Kulübüne 2009'da katılan ve 12 yıl boyunca yeşil kırmızılı formayı giyen stoper, Elazığspor'da geçirdiği bir sezonun ardından Karşıyaka'ya geri döndü. Metin Peker, yeşil kırmızılılarla birlikte 1. Lig, 2. Lig ve 3. Lig'de toplam 223 maça çıkmıştı.
Karşıyaka'nın yönetiminde ise büyük bir sarsıntı yaşandı. Karşıyaka Spor Kulübü'nde 2023-2024 sezonunda basketbol altyapı başkanlığı yapan Hatice Özalp, fon dolandırıcılığı iddialarıyla gündeme geldi. Özalp'in, yüksek kazanç vaadiyle birçok kişiyi dolandırdığı iddiaları üzerine yönetim tarafından görevden alındığı açıklandı. Kulüp yönetimi, konuyla ilgili olarak şu açıklamayı yaptı:
"Son zamanlarda yerel ve ulusal basında kulübümüzle ilgili yapılan haberler hakkında açıklama yapma gereği duyduk. Eski yönetim kurulu üyemiz Hatice Özalp'in kulübümüzü töhmet altında bırakan iddialarına ilişkin olarak belirtmek isteriz ki, Özalp yönetim kurulu toplantılarına katılmamış ve bu sebeple tüzüğümüz gereği üyeliği düşürülmüştür. Şu anda Hatice Özalp, yönetim kurulu üyemiz değildir. Yönetimimiz, yaşanan bu olayların kulübümüze zarar vermemesi için hukuki süreci titizlikle takip etmektedir."
